Разработан новый метод раннего выявления устойчивости у микобактерий туберкулеза

mikprotКак и все виды на нашей планете, бактерии постоянно развиваются. Некоторые изменения, происходящие в их ДНК, делают эти микроорганизмы устойчивыми к лекарствам, которые люди используют для лечения от вызванных ими заболеваний.

Лекарственно устойчивые бактерии обычно выживают во время лечения и передают свои гены другим бактериям, что приводит к накоплению лекарственно-устойчивых форм. Лучшим решением этой проблемы является лечение пациентов правильно подобранным антибиотиком в самом начале заболевания, но это нелегко. Врачи сначала должны идентифицировать бактерии заразившие пациента, затем выяснить, к каким препаратам они устойчивы. Результатов теста порой приходится ждать недели и месяцы.

Ученые из Оксфордского университета разработали программу «Mykrobe Predictor», которая исследует последовательность генома бактерии и выдает, к каким антибиотикам она устойчива, а к каким нет. Она может работать на обычном ноутбуке или планшете и проводит вычисления всего за несколько минут, что облегчает ее применение в лечебной практике. Статья, описывающая разработку, опубликована в журнале Nature Communications.

На данной стадии разработки ученые выбрали два вида патогенных бактерий человека: Staphylococcus aureus и Mycobacterium tuberculosis. Исследователи использовали данные об известных вариантах генов этих видов, которые дают бактериям устойчивость к разным видам антибиотиков. По результатам проведенного тестирования точность предсказаний оказалась довольно высокой. Для S. aureus устойчивость к 12 антибиотикам программа правильно предсказывает в 99,1 процентах случаев, а для M. tuberculosis в 82,6 процентах случаев, что, вероятно, связано с меньшей изученностью генетических механизмов устойчивости у этого вида.

Экспериментальное определение устойчивости культуры бактерий к антибиотикам занимает достаточно много времени — от одного дня в случае S. aureus до нескольких недель в случае M. tuberculosis. Использование Mykrobe Predictor может значительно сократить время подбора подходящих антибиотиков. В отличие от существующих методов, новое программное обеспечение может обновляться, то есть становиться лучше со временем. Оно также может выявлять инфекции даже в том случае, если бактерии уже были подвержены воздействию каких-то лекарств, но всё ещё присутствуют в организме.

Исследователи протестировали программу, используя ее для анализа более 4500 ретроспективных образцов пациентов, подбирая антибиотик к двум опасным бактериям туберкулезу (ТБ) и золотистому стафилококку. Программное обеспечение уже опробовано в больницах в Лидсе, Брайтоне и Оксфорде.

Источник: nature.com

Метки
Bactec АБП Абсцесс Аллергия Альвеолиты Анализы БЦЖ Беременность Биопсия Бронхи Бронхит Бронхоаденит Бронхоблокация Бронхолитиаз Бронхоскопия Бронхоэктазы Брюшина ВИЧ Вакцинация Витамины Гастрит Гепатит Гипертония Глаза Глотка Гортань Дезинфекция Дети Диабет Диспансер Диссеминированный Желудок Закон Зубы Иммунитет Инфильтративный КУМ Кавернозный Казеозная пневмония Кисты Кишечник Классификация Кожа Коллапсотерапия Кости Кровь Курение ЛФК Лаборатория Лазер Лимфогрануломатоз Лимфоузлы МБТ МЛУ МСЭ Менингит Микобактериоз Микоз Микроскопия Миндалины Мокрота Мониторинг Моча Мочеполовой Наркомания Нервы и психика Обследование Озонирование Опухоль Очаг Очаговый ПТК ПЦР Паротит Патогенетические Первичный Перикардит Печень Питание Пищевод Плазмаферез Плеврит Пневмокониозы Пневмония Побочные Поджелудочная Пожилые Позвоночник Посев Почки Профилактика Пьянство Рак Режимы лечения Рентген Рот Санаторий Санбюллетень Саркоидоз Сердце Симптомы Стационар Суставы Трахея Туб. интоксикация Туберкулома Устойчивость ФВД Фиброзно-кавернозный ХНЗЛ Химиотерапия Хирургия ЦНС Цирротический Шок ЭКГ Эмпиема Эндоскопия Язва